• في عام 1978 تم تأسيس وحدة للتدريب تابعة لمعهد بحوث إدارة المياه – أحد معاهد المركز القومي لبحوث المياه – في كفر الشيخ لتكون اللبنة الأولي لتدريب مهندسي الوزارة علي أنشطة تطوير الري. • في عام 1985 تم نقل مركز التدريب إلى القاهرة بالمقر الرئيسى للمركز القومى لبحوث المياه بشبرا المظلات تحت مسمي " مشروع التدريب والعمالة " للتوسع فى خدماته لتشمل برامج أكثر شمولاً لموضوعات متعددة فى مجال الرى والصرف والموارد المائية وتشغيل وصيانة محطات الطلمبات وغيرها. • في عام 1990 تم وضع حجر الأساس لمركز تدريب الموارد المائية والري بمدينة السادس من أكتوبر حيث تم البدء في تشغيله في 22 ديسمبر 1994 . • في عام 2002 تم توقيع الإتفاقية التي أصبح بمقتضاها المركز مركزا إقليميا يخدم المناطق الجافة وشبه الجافة تحت مظلة منظمة الأمم المتحدة للتربية والثقافة والعلوم (اليونسكو UNESCO). فرع كفر الشيخ • منذ عام 2004 تم استضافة مشروع التدريب التطبيقي لدول حوض النيل والمنبثق من مبادرة حوض النيل. • في عام 2004 تم توقيع اتفاقية تعاون بين المركز ومنظمة التعاون الدولي اليابانية (JICA) لتدريب كوادر من الأفارقة في مجال الري والصرف علي مستوي الحقل وكذلك تدريب كوادر من العراق واليمن في مجال المياه الجوفية والبيئة. • في عام 2007 تم استضافة مشروع التدريب علي الادارة بقطاع المياه بالتعاون الفني مع المؤسسة الألمانية للتعاون الفني (GIZ) .
• في عام 2008 تم إعادة تقييم المركز ورفع درجته إدارياً من مستوي مركز إلي مستوي قطاع بمسمي" قطاع تدريب الموارد المائية والري" وذلك بناء علي قرار رئيس الجهاز المركزي للتنظيم والإدارة رقم 417 لسنة 2008. • فى عام 2012 تم تعديل المسمي إلى "قطاع التدريب والتنمية البشرية" وذلك بناءعلى القرار الوزارى رقم 615 بتاريخ 19/11/2012 . • فى عام 2014 تم تعديل المسمى إلى "قطاع التدريب الاقليمى للموارد المائية والرى " بناء على القرار الوزارى رقم 945 بتاريخ 20/8/2014 . • يتبع المركز ستة فروع في : كفر الشيخ والزقازيق والفيوم والمنيا وإسنا ودمنهور